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Niepoort ist seit 1842 ein unabhängiges Familienunternehmen. Gegründet von dem Niederländer Eduard Kebe. 1847 bekam er einen Geschäftspartner Franciscus Marius van der Niepoort. Da Kebe kurz darauf starb, ging das Port House vollständig in den Besitz der Familie van der Niepoort über. 2012 übernahm Winzer Dirk van der Niepoort in 5. Generation das Ruder. Unterstützt werden sie dabei von der Familie Nogueira mit Kellermeistern.
Die Niepoort Lodges befinden sich im historischen Zentrum von Vila Nova de Gaia. Jährlich werden hier etwa eine halbe Million Flaschen Port hergestellt. Damit gehört es zu den kleineren Hafenhäusern. Der Hafen von Niepoort gilt als der süßeste Hafen.